در واقع از اصلی‌ترین مشکلات کولر آبی این است که هوای آلوده و نامطبوع را به راحتی وارد خانه خواهد کرد. این هوای آلوده امکان دارد دارای انواع میکروب و باکتری و عوامل بیماری‌زا باشد که هزاران بیماری تنفسی به دنبال داشته باشد. به همین دلیل است که اکثر افرادی که به مدت طولانی در معرض هوای کولر آبی قرار می‌گیرند دچار سردرد و گرفتگی بینی و … خواهند شد. تمام این مشکلات به دلیل هوای آلوده‌ای است که کولر آبی وارد فضای داخلی ساختمان کرده است.

البته موضوع دیگری که هرگز نباید از آن چشم‌پوشی کرد، پوشالی است که در کولرهای آبی استفاده می‌شود. این پوشال همیشه در معرض گرد و غبار و هوای آلوده قرار می‌گیرد و به دلیل اینکه به صورت مداوم خیس است، احتمال تولید انواع قارچ و میکروب و … را بسیار بالا خواهد برد. بنابراین اگر این پوشال هر چند وقت یکبار عوض نشود، احتمال ورود انواع میکروب و باکتری به داخل فضای داخلی ساختمان بسیار بالا خواهد بود و باعث انواع بیماری‌های تنفسی خواهد شد.